除了这些之外，朱载坖还下令将阿瓦城改称镇南府，大光改称仰光府，下诏设立缅甸布政使司，同时设立中南总督，下辖云南、缅甸两布政使司和安南都统使司以及大明在整个中南半岛上的藩属、属国、土司、羁縻州县等，任命殷正茂为南京兵部尚书总督中南等处军务事，驻节镇南府。
同时命令黔国公沐昌祚为镇守云南总兵官，同时移驻孟定府，随时准备提兵支援缅甸。
升广东水师副将邓子龙为缅甸水师总兵，驻节仰光，任命俞咨皋为平蛮前锋将军、镇守缅甸总兵官，驻节镇南府，任命陇川伯、后军都督府左都督刘显为提督中南水陆军务事，驻节仰光。
同时从各地招募士卒，携带家属前往缅甸，朱载坖下令从内承运库出银，每名士卒及其家属给行装银三十两，在缅甸分给土地五十亩，还有当地的华侨青壮，也可以参加官军，官府也会给予赏赐，分给土地，总之就是一件事情，尽快将缅甸消化下来。
除此之外，朱载坖还正式派遣使臣，前往暹罗、占城等国，商量驻军之事，朱载坖的意思是大明在两国一共驻军八千，暹罗五千、占城三千，由缅甸总兵指挥，大明不干涉暹罗、占城的内政，驻军也是为了保护两国王室不再受到侵略。
当然大明驻军保护暹罗占城，也不是没有回报的，朱载坖的条件是暹罗占城要将自己的港口租借给大明水师使用，同时大明每年向暹罗、占城支付白银十万两，用作大明租借两国港口的租金，剩余的银子就是从两国购买稻谷五十万石的银子，其中暹罗六万两，占城四万两。
相对应的，暹罗向大明提供三十万石粮食，占城提供二十万石粮食，大明还会给予两国一系列的贸易上的优惠，两国国王也比照朝鲜国王，虽然是郡王爵位，特旨赏亲王服色，朱载坖相信，暹罗、占城会答应的，如果不答应，大明可以换一种方式来说。
朱载坖处理完这些事情，下旨在京师为俞大猷建造府邸，召俞大猷回朝受爵。
做完了这些事情，朱载坖才和朱翊釴交流起来，朱载坖问道：“太子最近有什么想法啊？”
朱翊釴赶紧说道：“父皇开疆拓土，儿臣所不能及也。”
朱载坖笑笑说道：“这些话，那是那些臣子们说的，不是你这个太子说的。你说说怎么看此事的，或者说你觉得你日后要怎么做。”
朱翊釴说了自己的想法，朱载坖认为朱翊釴还是比较保守，朱载坖于是问道：“太子，你觉得是蒙古对大明日后的威胁大还是海上的西夷对大明日后的威胁大？”
朱翊釴和现在大明的所有臣子们的想法一样，那肯定是蒙古的威胁大，毕竟这点已经是刻在大明君臣的基因里的，朱载坖不否认蒙古人对大明的威胁很大，即便是现在，朱载坖也不敢保证大明官军就一定能战胜蒙古人。
但是来自海洋的利益和威胁显然被大明的君臣所忽视了，朱载坖说道：“太子，是九边长还是大明恶海岸长？”
朱翊釴思考了一下之后说道：“父皇，应该是大明的海岸长。”
朱载坖笑着说道：“那大明可以在九边修筑边墙，海上的敌人怎么办？也修一圈炮台把大明围起来吗？”这显然是不现实的，朱载坖将之前户部统计的隆庆七年的财政收支奏疏取出来，给朱翊釴看。