林夜和洛清瑶成功摧毁初代实验室的自毁装置，暂时逃过一劫。然而，当他们转身看向实验室的内部时，一幅令人毛骨悚然的景象映入眼帘。实验室的培养舱矩阵如同一片无边无际的森林，向维度的尽头不断延伸。每个培养舱内，都浸泡着一个洛清瑶的克隆体，她们有着不同的年龄，从婴儿到少女，从青年到成熟女性，仿佛时间在这个空间里被肆意扭曲。
林夜和洛清瑶缓缓走进这片培养舱的海洋，心中充满了震惊和愤怒。他们小心翼翼地穿梭在培养舱之间，每走一步，都能感受到一股压抑而诡异的气息。在众多培养舱中，一个最古老的舱体引起了他们的注意。舱体上显示着编号“000”，内部浸泡着一个胚胎。经过检测，这个胚胎与初代的基因匹配度竟高达99.9%。
“这……初代究竟在搞什么阴谋？”林夜看着胚胎，心中充满了疑惑。
洛清瑶也是一脸凝重：“看来初代的计划远比我们想象的要复杂和可怕。”
就在这时，林夜再也无法抑制心中的愤怒，他挥动星纹武装，朝着身边的培养舱斩去。随着一声巨响，培养舱被斩碎，泄露的营养液如同洪水般涌出。这些营养液似乎蕴含着某种神秘的力量，一接触到地面，便让生命母树的根系瞬间暴走。
根系如同疯狂的蟒蛇，迅速穿透实验室的墙壁和天花板，向着天空延伸，最终形成了一座巨大的血肉佛塔。佛塔散发着令人作呕的气息，塔内回荡着所有克隆体叠加的哭泣声。这些哭声仿佛来自地狱深处，充满了痛苦和绝望，让林夜和洛清瑶的内心都受到了强烈的冲击。
“不好，这根系暴走的情况比我们想象的还要严重。”林夜说道。
洛清瑶点了点头：“我们必须尽快找到解决的办法，否则，整个宇宙都可能受到影响。”
就在林夜和洛清瑶试图控制根系暴走时，初代日志的全息投影突然出现在他们面前。投影中，初代的身影浮现出来，他的脸上带着疯狂的笑容：“清瑶才是原始容器……林夜只是培养皿……”画面切换，显示出初代亲手将星门印记从洛清瑶额前移植给婴儿林夜的场景。
“不！这不是真的……”林夜看着投影，心中如刀绞般疼痛。他一直以为自己是拯救宇宙的关键，却没想到自己只是初代计划中的一个工具。
洛清瑶紧紧握住林夜的手：“林夜，不管你是不是培养皿，你在我心中都是最重要的人。我们一起，一定能摧毁初代的阴谋。”
林夜看着洛清瑶，眼中闪烁着坚定的光芒：“嗯，清瑶，我们一起。”
在愤怒和决心的驱使下，林夜和洛清瑶继续探索实验室。他们发现，培养舱的供能系统直通往生客栈银铃网络。每个克隆体的心跳都对应着某个星域的黑市交易额，仿佛这些克隆体的生命与宇宙的经济体系紧密相连。
“原来如此，初代通过控制克隆体的心跳，来操控星骸黑市的交易，从而获取巨大的利益。”林夜说道。
洛清瑶皱了皱眉头：“这也解释了为什么初代要制造这么多洛清瑶的克隆体。他不仅想要利用清瑶的力量，还想通过控制黑市来实现自己的野心。”
林夜和洛清瑶决定摧毁实验室的主控核心，彻底终结初代的阴谋。他们沿着培养舱矩阵，朝着主控核心的方向前进。在前进的过程中，他们遭遇了重重阻碍。不仅要躲避暴走的根系，还要应对实验室中各种自动防御系统的攻击。
这些自动防御系统形态各异，有的是悬浮在空中的能量炮台，不断发射出致命的能量光束；有的是隐藏在墙壁中的机械傀儡，突然跳出来发动攻击。林夜和洛清瑶凭借着默契的配合和强大的实力，一次次化险为夷。
终于，林夜和洛清瑶来到了主控核心的面前。主控核心散发着强大的能量波动，周围布置着层层防御。林夜深吸一口气，调动体内所有的力量，准备发动最后的攻击。
就在林夜即将动手时，所有克隆体突然睁眼。她们的瞳孔中映出药王谷、佛国与黑市的三重毁灭倒计时。倒计时的数字不断跳动，每一秒都仿佛在敲响宇宙毁灭的钟声。
“这……怎么会这样？”林夜看着克隆体瞳孔中的倒计时，心中充满了震惊和恐惧。
洛清瑶也是一脸凝重：“看来初代在克隆体身上设置了终极陷阱。一旦主控核心被摧毁，就会触发三重毁灭倒计时。”
林夜握紧了拳头：“不管怎样，我们不能让初代的阴谋得逞。就算是拼了这条命，我也要摧毁主控核心。”
洛清瑶点了点头：“林夜，我陪你一起。”
林夜和洛清瑶相互对视一眼，然后同时发动攻击。林夜挥动星纹武装，释放出强大的星纹能量，朝着主控核心冲去。洛清瑶则运用自己独特的力量，干扰周围的防御系统。