秋分时分，江湖突现“自然教”，其教徒身披“草木法衣”游走各地，宣称“文明乃自然之癌，唯有毁灭人类造物方能重还共生纯净”。练云铮在寒江剑派握剑伫立，剑穗残片的序章共生尘竟萌发杂草，小飞侠的翅膀浮现藤蔓纹路：“哥哥！他们在割裂江湖的文明根基！”
一、逆文明潮·江湖蒙尘
金陵城的铁匠铺被焚毁，铁器全被投入熔炉熔铸为农具；北境狼族的猎人被驱赶，所有猎弓遭碾压折断；西域商盟的驼队被强制解散，商道两旁种满荆棘。自然教教主“青帝”现身，其招式“自然十三逆”能操控植物与元素，练云铮的秩序剑意竟被藤蔓缠绕束缚。
“人类的每一次呼吸都在污染自然！”青帝挥动自然权杖，杖头花苞绽放出腐蚀性花粉，“看看这些钢铁建筑，哪一寸土地不被文明的毒瘤侵蚀？”小飞侠试图用治愈光雾净化花粉，却见光雾被转化为藤蔓，反加固了束缚。
二、自然圣坛·文明坟场
追踪至自然教总部“自然圣坛”，练云铮与小飞侠目睹青帝正在用“净化熔炉”炼化人类文明产物，炉中燃烧着书籍、兵器、农具，浓烟中浮现“返璞归真”的字样。青帝的真实身份竟是前神农谷谷主“百草生”，因研发的解药意外毒杀百人，遂认为人类智慧是一切罪恶之源。
“我的医术害死无辜，这就是文明的代价！”百草生操控元素锁链卷向练云铮，“你保护的江湖，不过是自己身上的脓疮！”练云铮运转文明剑意，却发现自然能量的核心是对“人类责任”的逃避，源于百草生对文明的彻底绝望。
三、自然溯源·共生之辩
练云铮挥剑划出“文明共生图腾”，剑意所至，藤蔓竟绽放出金属光泽。“文明是自然的延伸，”他斩断元素锁链，“钻木取火、筑屋避雨，人类从未脱离自然。你因一次失误否定全部，却忘了文明中蕴含的守护——医者救死扶伤，匠人造船渡人，皆是与自然的共生智慧。”
百草生的虚影出现裂痕，熔炉中映出他与弟子共研草药的场景，弟子曾说“草木有灵，文明有心”。小飞侠趁机用翅膀扫过自然权杖，唤醒百草生为救山火中村民而耗尽内力的记忆，元素锁链竟开始软化。
四、共生文明·自然归一
元素锁链崩解时，百草生被吸入自然核心，练云铮紧随其后，看见其记忆中反复播放的毒发画面。“你用毁灭逃避愧疚，却忘了文明的温度在于反思与进步，”练云铮将文明剑意注入核心，“共生的文明，是带着自然的馈赠，走可持续的路。”
百草生握着自然权杖痛哭，自然教众纷纷摘下法衣，露出对文明的眷恋。练云铮将自然权杖改造成“文明共生杖”，能调和自然与文明能量，自然圣坛的熔炉转化为“文明台”，台心生长出象征科技与自然共生的“金穗花”。
五、新生代·自然试炼
明镜学堂开设“文明共生课”，新生代侠士学习平衡自然与文明的智慧。狼族少主与百草生组队，深入北境重建猎人协会，同时设计“生态猎弓”；峨眉弟子在金陵城设立“文明驿站”，用雪舞剑式的剑意疏导反文明情绪。
“看！小猪侠的光雾能让铁器与草木共生！”小弟子指着光雾中的铁犁，其表面缠绕着能自动施肥的藤蔓。小飞侠趴在金穗花旁，翅膀上的藤蔓纹路转化为齿轮与花瓣交织的图案。