在接下来的战斗中，“黎明号”和战机编队不断试探巨像，故意激怒它发动攻击。随着时间推移，陈硕终于掌握了频率差扩大的规律：每发动三次强力攻击，巨像的频率差就会出现一次明显扩大，持续时间约为五秒。林夕迅速制定新战术：“下次频率差扩大时，郑宇带领精锐小队从左侧突击，吸引巨像注意力；‘黎明号’集中所有火力，瞄准它的能量核心，务必一击奏效。”众人领命，严阵以待。
当巨像再次抬起手臂，准备发动第三次强力攻击时，所有人绷紧神经。攻击过后，巨像的能量核心处果然出现频率差扩大的迹象。“行动！”林夕一声令下，郑宇带领小队如闪电般冲向巨像左侧，疯狂开火，成功吸引了巨像的注意。与此同时，“黎明号”所有武器系统全力运转，主炮、副炮、导弹发射器一同发射，无数能量光束和导弹汇聚成一股洪流，朝着巨像的能量核心奔涌而去。
巨像察觉到危险，试图转移能量防御核心，但为时已晚。能量洪流准确命中核心，引发了一场惊天动地的爆炸。巨像的身躯开始剧烈颤抖，体表的能量护盾如玻璃般破碎，光芒逐渐黯淡。随着一声巨响，巨像轰然倒塌，化作无数代码源碎片飘散在宇宙中。“我们成功了！”舰桥内爆发出一阵欢呼，所有人都沉浸在胜利的喜悦中。
在巨像倒塌掀起的能量余波渐渐平息后，“黎明号”缓缓降落在星球表面。众人怀着激动的心情，朝着存放第三把“代码钥匙”的地点进发。穿过一片由奇异晶体构成的山谷，一座古老而庄重的建筑出现在眼前。建筑大门紧闭，表面刻满与代码源相关的符文，散发着神秘气息。
郑宇走上前，尝试推动大门，却发现纹丝不动。林夕仔细观察符文，回忆着在之前遗迹中获取的知识，突然发现这些符文组成了一种特殊的密码。她将前两把“代码钥匙”的能量按照特定顺序注入符文凹槽，符文瞬间亮起，大门缓缓打开。
走进建筑内部，中央平台上放置着一把散发着柔和金色光芒的钥匙，正是他们苦苦追寻的第三把“代码钥匙”。钥匙呈不规则形状，表面流动着细腻的代码源纹理，蕴含着强大而温和的能量。林夕走上前，轻轻拿起钥匙，一种奇妙的共鸣在她体内响起，仿佛这把钥匙与她的意识产生了连接。
“黎明号”带着三把“代码钥匙”，按照遗迹中古老信息的指引，朝着宇宙深处的代码源修复中枢前进。一路上，宇宙中的异常现象愈发频繁，黑暗的能量风暴在星系间肆虐，部分星球的代码源能量濒临崩溃。林夕深知，他们肩负着拯救整个宇宙代码源文明的重任，时间紧迫，不容有失。
当“黎明号”抵达代码源修复中枢所在的神秘空间时，眼前的景象让所有人震撼不已。巨大的代码源矩阵悬浮在虚空之中，如同一颗璀璨的宇宙之心，每一个节点都闪烁着光芒，连接着无数神秘的能量丝线，延伸至宇宙各个角落。然而，矩阵周围环绕着浓厚的黑暗能量，不断侵蚀着代码源的光芒，部分节点已经变得黯淡无光。
林夕深吸一口气，与郑宇、陈硕等人一同走向代码源矩阵。他们将三把“代码钥匙”分别插入矩阵的特定位置，随着钥匙的嵌入，矩阵开始剧烈震动，光芒大盛。黑暗能量受到冲击，疯狂涌动，试图阻止修复进程。关键时刻，“黎明号”上的所有人员以及此前结识的星械族等盟友，纷纷将自身的代码源能量通过特殊装置输送到矩阵中。在众人齐心协力下，代码源矩阵的光芒逐渐压过黑暗能量，开始自我修复。随着一道道光芒闪过，宇宙中混乱的代码源能量逐渐恢复稳定，黑暗风暴渐渐平息，濒临毁灭的星球重新焕发生机。
当最后一丝黑暗能量消散，代码源矩阵恢复了往日的璀璨与生机。林夕望着眼前的景象，眼中闪烁着泪花。历经无数艰难险阻，他们终于成功拯救了宇宙的代码源文明。郑宇走到她身边，轻轻拍了拍她的肩膀：“我们做到了。”林夕转头看向他，露出欣慰的笑容：“是的，我们做到了。但这只是一个开始，宇宙中还有无数奥秘等待我们去探索。”此时，“黎明号”的引擎再次启动，在浩瀚宇宙中留下一道明亮的轨迹，向着新的未知征程启航，去书写更多关于勇气、探索与希望的传奇故事。