黑暗巫师召集了手下的黑暗军团，准备踏上寻找灵珠的征程。而此时，周王朝也察觉到了天地间的异样。姜子牙通过卜卦得知，一场巨大的灾难即将降临，而这一切似乎都与那颗现世的灵珠有关。姜子牙决定带领弟子们，寻找灵珠的下落，阻止黑暗巫师的阴谋。
姜子牙等人顺着灵珠散发的气息一路追寻，来到了东海之滨的渔村。他们从水生口中得知了灵珠被凤凰带走的消息。姜子牙心中明白，凤凰一族居住在神秘的梧桐仙境，凡人难以进入。但为了天下苍生，他决定冒险一试。
经过一番打听，姜子牙得知进入梧桐仙境的唯一方法，是找到一把传说中的“灵羽钥匙”。这把钥匙藏在一座古老的神秘遗迹中，遗迹中布满了各种机关和危险。姜子牙带着哪吒、杨戬等弟子，毅然踏上了寻找“灵羽钥匙”的道路。
他们来到神秘遗迹前，只见遗迹大门紧闭，周围弥漫着神秘的气息。姜子牙施展法术，打开了遗迹的大门。众人小心翼翼地走进遗迹，刚一进入，便触发了机关。无数利箭从墙壁射出，哪吒迅速舞动混天绫，将利箭纷纷挡下。众人继续前进，又遇到了一个巨大的迷宫。迷宫中道路错综复杂，稍有不慎便会迷失方向。杨戬放出哮天犬，哮天犬凭借敏锐的嗅觉，带领众人找到了出口。
经过重重困难，他们终于找到了“灵羽钥匙”。拿到钥匙后，众人马不停蹄地赶往梧桐仙境。在仙境入口，姜子牙用“灵羽钥匙”打开了通道，众人顺利进入梧桐仙境。
梧桐仙境中，仙雾缭绕，奇花异草遍地。凤凰一族的守护神兽——一只巨大的麒麟出现在他们面前。麒麟威严地看着姜子牙等人，问道：“你们为何闯入我凤凰一族的领地？”姜子牙恭敬地将黑暗巫师妄图夺取灵珠，危害天下的事说了一遍。麒麟听后，沉思片刻，说道：“我可以帮你们见到凤凰，但灵珠乃我族圣物，能否带走，还要看凤凰的意思。”
在麒麟的带领下，姜子牙等人见到了凤凰。凤凰听了姜子牙的来意后，心中也十分担忧黑暗巫师的阴谋。但灵珠对凤凰一族至关重要，它一时难以抉择。就在这时，黑暗巫师带着黑暗军团已经来到了梧桐仙境之外。黑暗巫师施展强大的黑暗魔法，试图强行闯入仙境。
凤凰感受到了黑暗巫师的威胁，它深知若不阻止黑暗巫师，天下必将大乱。于是，凤凰决定与姜子牙等人联手，共同对抗黑暗巫师。凤凰带着灵珠，与姜子牙等人一同走出梧桐仙境。
黑暗巫师看到凤凰和灵珠，眼中露出贪婪的光芒。他大喝一声：“把灵珠交出来，否则我让你们都死无葬身之地！”凤凰怒视着黑暗巫师，说道：“你这邪恶之徒，休想得到灵珠！”说罢，凤凰率先发动攻击，它展开双翅，口中喷出熊熊烈火，冲向黑暗巫师。黑暗巫师也不甘示弱，他挥动手中的魔杖，释放出一道道黑暗能量，与凤凰的火焰相互抗衡。
姜子牙等人也纷纷加入战斗。哪吒冲向黑暗军团，用乾坤圈和混天绫与黑暗士兵们展开激战；杨戬放出哮天犬，协助哪吒作战；姜子牙则在后方施展强大的法术，攻击黑暗巫师。一时间，喊杀声震天，双方展开了一场激烈的殊死搏斗。
战斗进入白热化阶段，黑暗巫师见久攻不下，决定施展禁忌魔法。他念起冗长而邪恶的咒语，天空中顿时乌云密布，一道巨大的黑暗光柱从天而降，直奔凤凰和姜子牙等人。凤凰感受到这股强大的黑暗力量，知道若不全力抵挡，众人都将性命不保。它将灵珠的力量全部释放出来，与黑暗光柱抗衡。
就在双方力量僵持不下时，水生突然出现在战场。原来，他放心不下姜子牙等人，偷偷跟了过来。水生想起凤凰曾给他的羽毛，他拿出羽毛，心中默默祈祷。羽毛瞬间化作一道五彩光芒，融入到凤凰与黑暗光柱的对抗之中。在五彩光芒的帮助下，凤凰终于成功抵挡住了黑暗巫师的禁忌魔法。
黑暗巫师见禁忌魔法被破解，心中大骇。他知道自己今日难以取胜，于是想要逃跑。姜子牙岂能放过他，他施展定身法术，将黑暗巫师定在原地。然后，他与凤凰一起，施展出最强的法术，彻底消灭了黑暗巫师。黑暗军团见首领已死，纷纷作鸟兽散。
危机终于解除，天下恢复了太平。凤凰感激水生的帮助，决定将灵珠的一部分力量赐予水生，让他能够继续守护渔村。而姜子牙等人，也因成功阻止黑暗巫师的阴谋，受到了天下百姓的敬仰和爱戴。这场因灵珠引发的危机，让人们明白了团结和正义的力量是无穷的，只要心怀正义，齐心协力，任何困难和邪恶都能被战胜。